Подскажите пожалуйста. Сын без загран паспорта добирается до Казахстана . Кто знает можно ли улететь в Армению из Казахстана по российскому паспорту?

Нельзя.

Не получится, если из Казахстана, то нужен загран (даже если полетит через Россию). Если полетит именно из России изначально, то без заграна можно.