Как правильно уведомить в миграционном отделе что я прибыл?? Заселяюсь в квартиру, это нужно сделать в течении 3 рабочих дней? Я могу один сходить или со мной должен идти также собственник жилья??

Уведомляет собственник, он может это онлайн сделать.

Бумажку дают в миграционном, туда владелец и вы вписываете данные свои паспортные, и все, в течении трёх дней с прибытия.

Вы никуда не ходите, уведомление делает принимающая сторона. и обязанность в трехдневный срок подать уведомление о прибытии установлена не для вас, а для принимающей стороны.

Можно онлайн и никуда не надо идти, визово-миграционный портал.