Подскажите, если паспорт заканчивается менее чем через 90 дней, в Турцию пустят?

120 дней уже.

Подружку неделю назад не выпустили в Стамбул. Причём был Новый паспорт, но она его с собой не взяла. Так бы, сказали, что переоформили посадочный.

120 на момент прилёта.