На своей машине поездить по местам экскурсий самим, Иссык -Куль и т. д., безопасно?

Да безопасно, только учитывайте что уже снег может выпасть в горах, скользко.

На всякий случай взять с собой местного человека, так как не во всех местах понимают русский язык. А в плане безопасности если не переходить границы морали , то наша страна очень гостеприимная))