Если прожил в Португалии более 183 дней и приобрёл статус налогового резидента Португалии, после чего продал квартиру в РФ, которая в собственности более 5 лет, соответственно налоги за неё не платишь.

Здравствуйте, я не эксперт но я думаю что оплата налогов от иностранной недвижимости (в этом случае Россия это заграница) только в случае двойного гражданства, а если рабочая виза и так далее это касается только заработка на территории Португалии. В любом случае такие вопросы лучше обсуждать со специалистом . По крайне мере из моего опыта рабочего резиденства в США.