Можно ли выехать из Казахстана по загран паспорту?

Конечно.

По заграну можно даже покупать билеты на внутренние рейсы по РФ .

Конечно, заграницей вообще всем все равно на внутренний паспорт, только Загранпаспорт имеет значение. То что в Казахстане его учитывают это исключительно из-за всяких договоров с РФ. И то им лучше загран чтобы был.