Подскажите, пожалуйста, чем отличается переезд в Армению по загран паспорту и по российскому? И по какому паспорту лучше оформлять билеты, если они с пересадками в России. Заранее благодарю!

Разницы совсем никакой нет, кроме штампа - в загран его поставят, в отличие от внутреннего. Последствий для покупки/пересечения границы также нет.

Лучше въезжать в Армению по заграну, так как в таком случае ставят печать в загран. в паспорт РФ печать не ставят. в дальнейшем это может понадобиться для более быстрого получения соц. карты и соблюдения 180 дней нахождения в стране (если Вы планируете быть тут на долгосрок)