А не будет ли проблем если заеду в Казахстан по Рф паспорту, смогу ли вылететь по Украинскому?

Не будет.

Спросят паспорт в котором отметка о въезде. Но у меня несколько лет назад прокатило, паспорт рф сдал в багаж, выпустили так.