Подскажите пожалуйста, если в течении 3х дней не успеешь зарегистрироваться, что будет?

В течение 3-х дней - это уведомление и предупреждение по КоАП. Зарегистрироваться нужно в течение 30 дней с момента въезда, чтобы остаться еще на 60 дней.