проще ли подать на Д6 в домашней стране или стране резиденции.

На визу, в принципе, можно подать только в стране гражданства или резиденции. Внутри португалии на визу в Португалию подать не возможно.

Виза, по поределению, это разрешение на въезд. Нельзя подать на разрешение на въезд в страну, когда вы уже въехали) Внутри странны можно подать на резиденцию, но не на визу.