Если девушка имеет еврейские корни по отцу и набор документов подтверждающий ее еврейство и хочет репатриироваться ей обязательно участие в этом процессе ее отца?

Конечно документы главное.

Хм, насколько я знаю там просто в анкете указываются лица, которые остаются в стране исхода и не репатриируются в Израиль. А свидетельство о рождении отца у нее есть? Консулу лучше показать оригиналы.