Подскажите, пожалуйста: 1) если получится оформить ВНЖ через въезд по D7 для меня и сына ( 16 лет)

1) Пять лет считаются либо с момента начала карточки внж, либо если ребёнок пять лет отучился в португальской школе. 2) Не возникнет.

Если вы подаетесь с саном старшим в Турции, например и ему тоже дают визу D, то тогда младшего вы воссоединяете изнутри - получаете на него ВНЖ и потом гражданство. Ждать его 18 лет не нужно. Если подаетесь в Москве, например, то виза D только у вас. Дети въедут по туристической визе. И обоих мальчиков нужно изнутри воссоединить с собой. И всем ждать 5 лет до гражданства.