Кто отправлял уведомление о прибытии в Казахстан по российскому паспорту, нормально всё проходит? не надо на латиницу переводить?

Это не верно. Можно по национальному паспорту уведомлять миграционку. Там есть несколько типов документов на выбор. Попробуйте повыбирать из них. У меня в большинстве случаев проходило через выбор типа документа как «национальный паспорт».

Добрый день, оно оформляется после пересечение границы, не позже чем через 5 дней.

Вносите тот документ, по которому пересекали границу.