если есть виза С и по ней из Испании получена учебная estancia по языковым курсам, то когда учебная estancia закончится, а виза С еще будет действовать - можно ли будет по ней оставаться еще 90 дней или же нет?

А на сколько по времени у вас учебная эстансия? После ее окончания даже если нет визы С, у вас есть ещё 90 легальных дней чтобы продлить ее по идее если захотите, но если нет то после этих 90 дней надо выехать из страны.

Вам правильно ответили, что после окончания студенческой эстансии есть ещё 90 дней для подачи на продление. После этого срока у вас начинается нелегальное пребывание в Шенгене. Если получать визу D в Консульстве, то они обычно туристический Шенген ануллируют, а визу в паспорте зачёркивают. Даже если она была на 5 лет. Как поступают в эстранхерии в Испании я не знаю. Но туристическая виза может быть ануллирована автоматически при получении тархеты, т. е. виза может быть недействительной, даже 5сли её не зачеркнули. Так как по шенгенских правилам нельзя иметь две визы или визу + вид на жительство.

Что касается правила 90/180 то я в своё время узнавал в Консульстве. Время легального нахождения по виду на жительство в этом сроке не учитывается, т. е. прожив год по студенческой карте можно хоть через день въехать по тур. визе и прожить ещё 90 дней. Но это если выехать. А вот можно ли остаться жить на 90 дней по тур. визе я не знаю, потому как я выше написал тур. визы одновременно со студенческой тархетой у вас по правилам быть не может.