Скажите, пожалуйста, гипотетически: вот я в Италии заканчиваю магистратуру и хочу в тот же вуз поступать на phd – мне нужно возвращаться в рф и подаваться на студенческую визу? если у меня внж, то наверное не нужно, так ведь?

По идее должны. Виза даётся под конкретную учёбу, внж - тоже. Цель другая уже. Меня в квестуре отправляли в Москву, когда виза под языковые курсы истекла, истекал внж, а я подавался на мастерскую программу. Летал в мск за новой визой и подавал на продление. Узнайте в квестуре.