Как убедить иммиграционных консультантов, которых нанял будущий работодатель, подаваться на ВНЖ по 90.2? Они говорят, что по шенгенской визе нельзя работать, нельзя подписать контракт с работодателем, и поэтому заставляют делать визу D3.

Сказать - что вы будете работать со сторонними иммиграционными консультантами.

Я пригрозил тем, что буду искать другого работодателя, если они не согласятся на мои условия, они тоже хотели через визу. Хотя у меня все нужные документы уже были на руках. Внезапно после этого оказалось, что я действительно могу подписать контракт.

Это не ответ а уточнение для меня, т. к. я долго пытался сообразить в чем суть проблемы и что мне для себя надо иметь ввиду. У Вас уже есть какой-то Шенген по которому Вы можете оказаться в Португалии и поэтому Вы не хотите тратить время на получение рабочей визы, а хотите податься уже на месте на внж. Если бы у Вас не было никакого Шенгена, Вы бы ничего не имели против D3. Верно я понимаю?