возможно ли такое что не зарегистрируют на рейс пегасус потому что билетов продано больше чем мест? Вообще разве такое бывает?

Это называется овербукинг и чаще практикуется лоукостерами. Согласно статистике, всегда есть некий процент пассажиров, который отказывается от билета или не является на рейс: именно в рамках этого процента авиакомпании продают дублирующие билеты. Но иногда на рейс являются все: и те, кто мог бы отказаться и те, кто купил дублирующие билеты;) Такие данные доступны только авиакомпании.