с паспортом РФ и визой в Милане где и как можно вакцину сделать?

Нигде.

В Ломбардии можно привиться без кодиче , но нужен SSN как сделать в Ломбардии. Остальные регионы по тому же принципу, в некоторых никаких документов не надо Или codice получать в Москве в консульстве.