Мой вопрос был : заезжая в РФ менее чем на сутки, в Ивангород, каким образом я там должна сдавать Тест, и должна ли вообще его сдавать, если в этот же день выезжаю? Не могу ни где найти эту информацию.

При возвращении из РФ вы въезжаете с территории третьей страны. В Эстонии это означает либо карантин, либо тест. Не важно, насколько вы выехали, хоть на пять минут. Если вы потом в Германию, то вам надо уточнить на сайте вашей страны.