Подскажите, что значит прямой билет? И является ли такой вариант прямым?

Это просто стыковка. Билет не единый, но это нормально в данном случае. Надо выйти, забрать багаж в Ереване и далее регистрировать его заново уже в Ларнаку. Разные а/компании. Все ок, Вы не первый этим маршрутом летите)