Скажите, как лучше и быстрее добраться из Питера в Таллинн: на автобусе Эколайнс или же маршруткой до Ивангорода и поездом Нарва-Таллин?

Однозначно второй вариант. Без всякого сомнения.

Автобус вот сегодня уже 5 часов на границе стоит:( пешком мы быстрее переходили всегда:( Поезд до Таллина тоже очень приятный. Про маршрутку не знаю.