Я из Узбекистана, закончил филиал МГУ в Ташкенте, вопрос, будет ли мой диплом, в связи с отключением российских вузов от балонской системы, котироваться в Канаде?

Что значит котироваться? Сможете ли Вы его эвалюировать? Да, сможете. Будут ли его принимать работодатели? Им редко нужен диплом, но если нужен, вряд ли будут проблемы.