В случае, если в Казахстане ТОО занимается разработкой ПО, для него без разницы, какой иметь юр адрес, или желательно иметь адрес по факту в ЦОН какого района сможешь явиться?

Там речь уже о налоговой. Да, налоговая будет в районе ЦОНа.

Если тоо зарегистрировано уже вы можете поменять юридический адрес онлайн если у вас мелкий или средний бизнес, если крупный то нужно ехать самому в цон по месту регистрации и сдавать туда документы протокол собрания или решение учредителя и изменения в устав плюс заявление о смене адреса.