Оплатили пошлину Wes, планируем развернуть все электронно. Понимаю, что дальше универ должен по заявке Wes отправить «все верно» или справку. Но как уведомить сам универ об этом процессе?

Это если у вуза есть вот этот налаженный контакт/соглашение с WES. Я в свой вуз позвонила в международный отдел, они сказали, да, мы сотрудничаем, скиньте скан диплома и ваш референс номер с wes, мы сами все отправим.

Если вуз не сотрудничает, просто отправляйте, без вопросов "можно ли".