Подскажите, если надолго выехать за территорию Канады ( условно - не возвращаться до конца ворк пермита)

Судя по опыту - да, если ваша компания не против (не все компании могут держать человека вне страны из-за налоговых вопросов). Но эти дни вам потом в зачет гражданства не пойдут. Ну и на всякий случай пообщайтесь с консультантом на эту тему, мало ли какие подводные камни могут быть.