Перелёт через Стамбул не по единому авиабилету. Но посадочные на второй авиарейс уже есть. Обязательно ли в Стамбуле «выходить» в город или всё-таки можно будет воспользоваться зоной международной пересадки аэропорта?

Без багажа не надо.

Нельзя) сразу выходите через паспортный контроль. Получайте багаж и обратно, сдавайте и проходите. Всё проходит быстрее, если говорите везде что просто пересадка и торопитесь) расстояния там очень огромные в аэропорту.

Если туркиши, то можете уточнить на стойке регистрации что багаж до конечного пункта.

У меня был не единый билет. Чемодан сдала в Сан Фран сразу до Москвы, даже по раздельному билету. Спросите когда будете у стойки сдавать багаж. Когда прилетели в Стамбул прямо при выходе из самолете стоял работник аэропорта и всем подсказывал кому куда в зависимости от пересадки и если проводите ночь в Стамбуле.