в Новом Афоне сильно мешает звук поездов ночью? Судя по карте, чтобы попасть на пляж, нужно переходить железную дорогу, это так?

Ни разу не мешает.

Там поезда ходят утром и днём, но и грузовой пару раз был ночью. Не сильно, больше машины, если недалеко дом от Сухумского шоссе, там сумасшедший трафик.

Ж/д надо переходить. Там всего 2 поезда, утром туда, днём и вечером назад.

Смотря где вы остановитесь, мы жили в центре ( царская Аллея), ничего не слышали, переходить не надо, пути в горах ведь проходят. И пляж протяженный. Мы гуляли вдоль плчжей далеко направо, и ещё дальше налево. Нет там путей никаких.