Как на автобусе ездить с leap-картой правильно? Если ехать 3 остановки, на выходе некуда приложить, списалось 2,5 по факту. Или это так и задумано, и там не по зонам?

Нужно говорить водителю остановку и у него списывать.

Если у вас обычная лип карта, то за день поездок на автобусе спишется не более 7€, если автобус и дарт или луас, то немного больше сумма. Если студенческая, то не более 5 € в день. Если в день только одна поездка и 3 остановки, тогда лучше прикладывать карту к коробочке у водителя и самому говорить сумму, до 5 остановок 1.25, потом 2.25.