из Нарвы в Таллин ездят дневные электрички? Как я понял, они маленькие, вагона 3 всего? Желающих много? Всем места хватит?)

Желающих много всегда. В Нарве ещё можно сесть. В Йыхви - уже вероятность мала. А потом только стоя. Рекомендую брать 1 класс. Он на пару евро дороже. Но зато гарантировано сидячее место и никто не будет стоять над душой, давя на совесть.