Я живу в Чехии по ВНЖ, в котором прописан номер паспорта. Я хочу поехать в Россию и сделать новый паспорт старого образца (его не выдают как второй..значит первый дырявят). Я могу вернуться в Чехию по дырявому паспорту?

Спросите у чешских пограничников.

Если у вас чешский внж, вы наверняка можете написать их погранцам в электронном виде, получить ответ и предъявить его на границе в случае проблем. Это гораздо лучше, чем оправдываться перед погранцами словами "а мне в инете сказали... " Инет не имеет силы, а ответ погранслужбы имеет.

По дырявому конечно вряд ли сможете, но что мешает сделать новый загранпаспорт нового образца как второй? Тогда дырявить не будут старый.