Через Эстонию попасть в Европу реально?

Конечно. Но для Эстонии нужна прививка хотя бы Спутником (плюс 21 день после второй прививки). Кроме того, для выезда из РФ в Эстонию по земле нужны основания по распоряжеию 763-Р (на самолете основания эти не нужны).