Вопрос такой: в прошлом году работала схема выехать через Эстонию с визой и основаниями в ЕС. Действует ли она сейчас? У меня виза С немецкая (по приглашению партнёра) Спасибо заранее за ответ!

Вполне.

1. У Вас есть основания для выезда из РФ по земле (приглашение партнера для РФ - не основание)? 2. У Вас есть вакцина, чтобы пустили в Эстонию (без вакцины - только по спецразрешению ppa могут впустить в Эстонию при наличии приглашения партнера)?

Теоретически могут к партнеру пустить напрямую из РФ в Германию, прецеденты есть, но это индивидуально - нужно у немцев спецразрешение запрашивать, просто так могут на самолет в Германию не посадить.