Подскажите, могу я самостоятельно покинуть транзитную зону и не лететь дальше, рейс с пересадкой, Хургада -Стамбул-Москва, выйти в стамбуле и все, не имея багажа или не выпустят?

Билет в один конец? Если в один- можете. И багаж, еси есть, надо в мск сказать чтоб до Стамбула регили. Если билет туда_обратно, и вы не полетите по одному из сегментов, то дальше всё отменят))

Если тест есть, то да. Если теста не будет, то привет карантин на 7 дней за своей счёт.