Скоро летим из Йоханесбурга в Москва Еtihad. Подскажите, пожалуйста, если кто-то летал недавно этой авиакомпанией, спрашивают ли ПЦР при вылете или пересадке?

Не нужен пцр. Но это надо им пояснять и напоминать об этом. На транзите вообще ниче не смотрят. Если в транзите город гулять пойдете-то смотрите услрвия страны транзита.