Собираюсь с супругой съездить в Латвию. Я гр. Латвии супруга РФ. Думаю через Эстонию. Какие могут ожидать сюрпризы на границах.?

Как гражданин Латвии, Вы с супругой россиянкой и напрямую из России в Латвию можете выехать Эстония не нужна при этом.

Лучше через Белорусь.

Никаких, главное свидетельство о браке не забудьте.