Подскажите, если получить боравок (внж) по причине владения квартирой в Черногории, есть ли ограничения по нахождению в стране чтобы не потерять боравок? Например, можно ли получить боравок, иметь его, но жить в России?

Надо. 11 месяцев, если не ошибаюсь. Или каждый раз придётся заново оформлять.

Нельзя. Отсутствие 30 дней, в редких исключениях до 90 с предваритальным посещением инспектопа и написанием объяснительных, заверенных нотариусом.