Как поступить в такой ситуации Мы заплатили за аренду комиссию на СК и два залога, договор должны были подготовить на следующий день, но квартира находится близко возле дороги и шумно, если мы откажемся, нам вернут деньги?

Комиссия, это оплата за услугу. вам её оказали. и вы согласились с предложенным вариантом заплатив. так что имеет полное право не отдать обратно. а вот что вы оплатили дальше? Два депозита? Оплату за первый месяц и депозит? Депозит вернут, так как это оплата за возможный ущерб. в сердцах ничего не сломали? а с остальным вопросы. но тем не менее, надо разговаривать, люди в своем большинстве здесь адекватные. Маленькое уточнение. с позиции силы здесь разговаривать, себе дороже станет.( Но к вам же это не относится?)

Имеют право аренду не возвращать:) хотя - вопрос договорённости.