Есть ли поисковик авиабилетов на внутренние рейсы на Филиппинах? Или подскажите, как выгоднее замкнуть маршрут манила -себу- бохол-палаван-корон-манила?

Так есть же сайт Себу Пасифик Эир.

Если коротко, то нет, авиакомпании маленькие, с агентами не работают. Поэтому заходите на англоязычную википедию аэропорта, смотрите кто туда летает и штудируйте сайты компаний в поисках нужных билетов.