Подскажите, что значит информация в статье о покупке жд билетов из Будапешта в Вену? нельзя взять билеты туда-обратно на новом сайте венгерских жд?

Нет, речь о том, что находясь в Вене не надо покупать на сайте венгерских жд. Про туда обратно там не сказано)

Спокойно недавно съездил туда и обратно на поезде obb в Вену, билеты брал у mav , с почты билеты распечатал, в поезде qr код с него просто два раза сканируют и всё, никаких проблем не возникло.