У меня вот один вопрос Если гражданин России имеет армянский паспорт но у него в паспорте написано временное проживание в России. Он может с этим паспортом полететь Минводи?

Если он гражданин России и хочет на этом основании вернуться - он должен предъявить российский паспорт российским пограничникам. Если он гражданин Армении и у него есть ВНЖ в рф - это тоже основание. Но какая то отметка о временном проживании в армянском паспорте вряд ли является основанием.