сколько стоит снять двухкомнатную квартиру, можно ли снимать напрямую от собственника и платится ли депозит агенту и т. д?

Цена зависит от города/деревни и района в городе. И от состояния квартиры и дома конечно. Можно и от собственника, и от агенства, и от частного агента - как найдете. Услуги агента всегда оплачивает собственник. Депозитов обычно 3 (и больше), но можно договариваться.