Подскажите пожалуйста если прилететь в Стамбул в 13 45, а вылет в Анталью в 15 45, я успею на этот рейс?

Должны. Часа с головой хватает.

Если транзитный то - да.

Аэропорт один? Лично мы с одного на другой много времени потеряли.

Только правильно идите. Из зала с чемоданами берите влево по залу прилёта до эскалатора, который поднимет на второй этаж в зал вылета. Иначе потеряете время, чтобы сориентироваться.