Гражданин РФ, открывший счет и получивший в армянском банке карточку Visa, может на территории РФ пополнить счет, например, онлайн через карточку Мир?

Может, но не напрямую. С Мир на рублевый счет, потом конвертация на валютный счет с Visa.

Согласно указу №79 от 28.02.2022 запрещено переводить деньги на свой зарубежный счёт со счёта в РФ. ЦБ РФ позже разрешил переводы в адрес членов семей, но детали не помню