Здравствуйте! Minsk Minsk Intl 2 (MSQ) и Минск Минск аэропорт (MSQ) это один и тот же аэропорт?

Да, один и тот же. В Минске, по сути, только один действующий аэропорт - Минск 2, он же международный - International. Аэропорт Минск-1, который находится в черте города, уже несколько лет не эксплуатируется, существует как архитектурный памятник.