Что нужно взять с собой в Японию в сентябре?

Смотря, куда собираетесь. если на юг, на Кюсю - берите купальник и шорты. Если на Хоккайдо - свитер и куртку )).

В целом сентябрь хороший теплый месяц, тайфуны уже прошли, в Токио, Киото должно быть очень хорошо.