Объясните, почему в геохронологической шкале временные отрезки эры имеют различную продолжительность.

Это происходит потому, что геохронологическая шкала отсчитывает временные отрезки эры исходя из определенных ключевых событий, например, падение метеорита, серьезные климатические изменения и т.д. А как вы понимаете, эти события не происходят абсолютно в разные промежутки времени, они друг с другом не связаны, отсюда и разные периоды в эрах.