При пригоне из Италии своего авто на итальянских номерах могу в Литве поставить сразу на литовские и что для этого нужно. Регистрация и гражданство Литовское.. Нужно ли снимать с учета в Италии или можно всё сделать в Литве…?

А как авто стало Вашим в Италии, если у Вас всё Литовское?

Если Вы в т.ч. налоговый резидент Литвы, то надо полагать, Вам на нём в Литве ездить нельзя.

Конечно, надо оформлять и ставить на учёт в Литве.

А снятие в Италии может быть и автоматическим, после регистрации в Литве, или можно оформить транзит и экспорт в Италии, на Ваш выбор.