Коллеги, вьезжал на авто с европейскими номерами через латвийско-российскую границу, внес депозит как временный ввоз.

Насколько я знаю есть разные способы вернуть депозит: можно при выезде наличными его забрать, и в вашем случае действительно его не получится вернуть, но вроде есть вариант вернуть его себе обратно БН на российский банковский счет, и это можно сделать уже после того как машина покинет территорию ЕАЭС.