Подскажите пожалуйста, собираемся вылетать из Москвы на Кипр, есть паспорта РФ и паспорта Молдовы , брать авиабилеты сразу по паспортам Республики Молдова? Не будут в аэропорту спрашивать регистрацию при вылете по паспортам Молдовы?

Билеты на паспорта РМ, с собой оба, на паспортном контроле в РФ - паспорт РФ.

При вылете и влете в РФ на пограничном контроле показываете только паспорт РФ. На аограничном контроле на Кипре прказываете молдавские. Билеты, как вам уже подсказали. Также и на стойках регистрации показываете молдавские