Уточните, кто знает, регистрируется ли превышения скорости в Литве на транспортное средство с номерами РФ?

Регистрируются. Могут. Действует.

Это может «прийти» к вам и через 2 года (т.е. до следующего въезда), а тогда уже с процентами через пристава.. Если где-то нарушали и хотите «чистый хвост», позвоните в полицию (а лучше заедете в отделение дорожной службы) и уточните по номеру авто.